Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms