Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a3Q9ERH8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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