Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ7

Rims2, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims2Q9EQZ7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims2Q9EQZ7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims2Q9EQZ7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims2Q9EQZ7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims2Q9EQZ7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims2Q9EQZ7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims2Q9EQZ7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rims2Q9EQZ7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims2Q9EQZ7 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms