Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Vmn1r44Q9EQ47 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Vmn1r44Q9EQ47 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Vmn1r44Q9EQ47 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Vmn1r44Q9EQ47 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Vmn1r44Q9EQ47 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Vmn1r44Q9EQ47 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Vmn1r44Q9EQ47 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Vmn1r44Q9EQ47 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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