Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Cxcr6Q9EQ16 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms