Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SgshQ9EQ08 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms