Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sil1Q9EPK6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sil1Q9EPK6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms