Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms