Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms