Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms