Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms