Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms