Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms