Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9P2

Ccdc103, Coiled-coil domain-containing protein 103, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc103Q9D9P2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc103Q9D9P2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc103Q9D9P2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms