Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b2Q9D9N2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms