Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms