Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V0

Hm13, Minor histocompatibility antigen H13, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hm13Q9D8V0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hm13Q9D8V0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms