Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms