Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms