Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Gtf3c6Q9D8P7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Gtf3c6Q9D8P7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Gtf3c6Q9D8P7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Gtf3c6Q9D8P7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Gtf3c6Q9D8P7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Gtf3c6Q9D8P7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gtf3c6Q9D8P7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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