Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms