Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cldn22Q9D7U6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cldn22Q9D7U6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Cldn22Q9D7U6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Cldn22Q9D7U6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn22Q9D7U6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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