Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6K7

Ttc33, Tetratricopeptide repeat protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc33Q9D6K7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc33Q9D6K7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc33Q9D6K7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms