Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
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Ttc9bQ9D6E4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
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Ttc9bQ9D6E4 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
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Ttc9bQ9D6E4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms