Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc39Q9D5Y1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Ccdc39Q9D5Y1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Ccdc39Q9D5Y1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Ccdc39Q9D5Y1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Ccdc39Q9D5Y1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Ccdc39Q9D5Y1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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