Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930449I24RikQ9D5E3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms