Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zc2hc1bQ9D534 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zc2hc1bQ9D534 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zc2hc1bQ9D534 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zc2hc1bQ9D534 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zc2hc1bQ9D534 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zc2hc1bQ9D534 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zc2hc1bQ9D534 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zc2hc1bQ9D534 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zc2hc1bQ9D534 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zc2hc1bQ9D534 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zc2hc1bQ9D534 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zc2hc1bQ9D534 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zc2hc1bQ9D534 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Zc2hc1bQ9D534 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Zc2hc1bQ9D534 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Zc2hc1bQ9D534 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Zc2hc1bQ9D534 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms