Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrameQ9D4Z5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrameQ9D4Z5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PrameQ9D4Z5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrameQ9D4Z5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrameQ9D4Z5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrameQ9D4Z5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrameQ9D4Z5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrameQ9D4Z5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrameQ9D4Z5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrameQ9D4Z5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrameQ9D4Z5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrameQ9D4Z5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PrameQ9D4Z5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrameQ9D4Z5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrameQ9D4Z5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrameQ9D4Z5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrameQ9D4Z5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrameQ9D4Z5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrameQ9D4Z5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrameQ9D4Z5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrameQ9D4Z5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrameQ9D4Z5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrameQ9D4Z5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms