Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms