Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms