Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms