Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D454 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D454 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D454 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D454 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D454 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D454 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D454 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D454 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D454 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D454 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D454 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D454 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D454 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D454 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D454 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D454 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D454 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D454 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D454 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D454 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D454 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D454 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D454 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D454 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D454 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D454 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D454 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D454 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D454 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D454 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D454 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D454 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D454 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D454 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D454 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D454 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D454 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D454 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D454 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D454 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D454 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D454 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D454 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D454 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D454 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D454 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D454 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D454 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D454 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D454 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D454 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D454 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D454 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D454 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D454 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D454 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D454 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D454 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D454 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D454 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D454 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D454 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D454 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D454 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D454 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D454 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D454 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms