Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pus10Q9D3U0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus10Q9D3U0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms