Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms