Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stag1Q9D3E6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms