Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3B1

Hacd2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd2Q9D3B1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd2Q9D3B1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms