Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms