Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Snx20Q9D2Y5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Snx20Q9D2Y5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Snx20Q9D2Y5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Snx20Q9D2Y5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Snx20Q9D2Y5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Snx20Q9D2Y5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Snx20Q9D2Y5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms