Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D2Q3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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