Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms