Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D1F3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D1F3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D1F3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D1F3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D1F3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D1F3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D1F3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D1F3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D1F3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D1F3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D1F3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D1F3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms