Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Hddc3Q9D114 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hddc3Q9D114 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Hddc3Q9D114 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Hddc3Q9D114 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hddc3Q9D114 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hddc3Q9D114 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hddc3Q9D114 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Hddc3Q9D114 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Hddc3Q9D114 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Hddc3Q9D114 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Hddc3Q9D114 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Hddc3Q9D114 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Hddc3Q9D114 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms