Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms