Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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