Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms