Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
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Ccdc47Q9D024 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Ccdc47Q9D024 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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