Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp11Q9CZJ1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Utp11Q9CZJ1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Utp11Q9CZJ1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Utp11Q9CZJ1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Utp11Q9CZJ1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp11Q9CZJ1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp11Q9CZJ1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp11Q9CZJ1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp11Q9CZJ1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp11Q9CZJ1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp11Q9CZJ1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp11Q9CZJ1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp11Q9CZJ1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp11Q9CZJ1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp11Q9CZJ1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp11Q9CZJ1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp11Q9CZJ1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp11Q9CZJ1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms