Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms