Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Bud23Q9CY21 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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