Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms